نقش اساسی عنصر روی در فعال سازی تعداد زیادی از آنزیم گیاهی می باشد. این عنصر یا مستقیماً در ساختمان آنها شرکت دارد و یا اینکه برای فعال سازی آنزیمها لازم است. کمبود روی تشکیل پروتئین گیاهی را دچار اختلال می نماید. روی تأثیر زیادی در متابولیسم گیاه دارد و به طور کلی متابولیسم کربوئیدرات ها، پروتئین، اکسین و فرآیندهای زایشی تحت تاثیر شدید کمبود روی قرار می گیرند.کمبود روی باعث کاهش 70-50 درصد فتوسنتز، کاهش تعداد کلروپلاست، کاهش وزنی پروتئین می شود. همچنین گیاهان دچار کمبود روی از نظر عوامل تنظیم کننده رشد، دچار مشکل هستند.